Egy független szakértői csoport (Eltér István MÉK-elnök vezetésével) alternatív masterplan-t és koncepciót dolgozott ki a Liget Budapest projekt kapcsán. Olyat, amely – szándékai szerint – akár találkozhat a kormányzati elképzelésekkel is, de amely teret ad egy a jelenleginél jóval megalapozottabb és szélesebb tömegbázisra építő városrehabilitációs lépéssorozatnak (melynek például része lenne a Rákosrendezői Pályaudvar hasznosítása is). Az alternatív masterplan alappillérei (melyek egyben reagálnak a Liget-projektet érintő legfőbb kritikákra is):
- A jelenlegi beépítés nem nőhet,
- A Városligeten belül jelentős bontásra és funkciótisztításra van szükség,
- A Liget mai zöldfelületein ne jelenjen meg új épület,
- Jelentős meglévő épületek rekonstrukciója és újrahasznosítása,
- Az új múzeumi épületek tömegének jelentős része kerüljön a felszín alá,
- Egyes múzeumi funkciókat a városon belül máshol kell megvalósítani (pl. Millenáris Park, Sipeky és a Róheim villák).